Web Sites
Biota/Fapesp - O Instituto Virtual da Biodiversidade: website do programa com informações sobre a concepção e estratégia do programa, a avalição do Scientific Advisory Committee, informações sobre os projetos concluídos e em andamento e instruções de como submeter uma proposta à Fapesp.
Sistemas de Informação
speciesLink é um sistema de informação distribuído para recuperação de dados de acervos de coleções biológicas e de observação em campo. Disponibiliza também uma série de ferramentas para visualização de dados e verificação de possíveis erros.
O INCT Virtual da Flora e dos Fungos tem como missão prover à sociedade em geral, ao poder público e comunidade científica em especial, infra-estrutura de dados de qualidade de acesso público e aberto integrando as informações dos acervos dos herbários do país e repatriando dados sobre coletas realizadas em solo brasileiro, depositadas em acervos no exterior.
SinBiota é um Sistema de Informação Ambiental para o Estado de São Paulo desenvolvido para armazenar dados de coletas e inventários realizados pelos projetos vinculados ao Programa Biota/Fapesp.
O Sistema de Informação de Coleções de Interesse Biotecnológico, SICol, é fruto do Programa Nacional de Biotecnologia e Recursos Genéticos do Ministério da Ciência e Tecnologia e tem por objetivo, além de disseminar informações sobre os Centros de Recursos Biológicos do Brasil, servir de elemento integrador às diversas e diferenciadas coleções de interesse biotecnológico.
O nodo OBIS in Brazil: Tropical and Subtropical Western South Atlantic (WSAOBIS) é um dos 3 nodos (na Argentina, no Brasil e no Chile) do antigo nodo regional da América do Sul (OBIS SA). O projeto contou com o apoio inicial da Fundação Alfred P. Sloan através da Rutgers (State University of New Jersey). A iniciativa no Brasil é da USP em convênio com a PETROBRAS. O objetivo desse nodo é consolidar a contribuição regional no Portal OBIS e que é uma das iniciativas do Census of Marine Life (CoML)
Revistas e Artigos
A revista Biota Neotropica, editada pelo Programa Biota/Fapesp - O Instituto Virtual da Biodiversidade, publica resultados de pesquisa original, vinculadas ou não ao programa, que tratam da temática conservação e uso sustentável da biodiversidade na região Neotropical.
Bioline International é um serviço de publicação eletrônica sem fins de lucro comprometido em prover o acesso a publicações de qualidade de países em desenvolvimento. É gerenciado por cientistas e bibliotecários num trabalho cooperativo entre as Bibliotecas da Universidade de Toronto, Canadá, que faz o gerenciamento; o Centro de Referência em Informação Ambiental, CRIA, Brasil, responsável pelo armazenamento e gerenciamento dos bancos de dados; e o Bioline/UK.
CHECK LIST dedica-se a publicar listas de espécies, mapas de distribuição geográfica e notas sobre a distribuição geográfica de quaisquer táxons. Esse tipo de estudo tem sido negligenciado por ser considerado "muito básico" or "não tendo uma aplicação relevante". No entanto, esforços para preservar os remanescentes naturais de espécies são fundamentais para a perpetuação da vida como ela tem evoluído. O primeiro passo para se conseguir isso é manter o registro da distribuição das espécies. Portanto, a CHECK LIST foi criada para preencher essa lacuna através da publicação de artigos relacionados a tão importantes inventários.
Ferramentas
A World Community Grid usa a tecnologia de grid computacional para formar uma infraestrutura permanente e flexível que fornece a pesquisadores uma grande estrutura computacional que pode ser usada para resolver problemas que afligem a humanidade. A tecnologia de grid agrega um grande número de computadores, criando um sistema com grande poder de processamento que supera o poder computacional de alguns supercomputadores juntos.
OpenModeller, ambiente computacional multi-plataforma voltado para modelagem de distribuição espacial. Capaz de trabalhar com diversos algoritmos, o openModeller pode ser usado através de interfaces de programação, incluindo C++, SOAP e SWIG-Python, bem como através de interfaces gráficas amigáveis.
O projeto responsável pelo desenvolvimento da rede speciesLink desenvolveu uma série de ferramentas de acesso livre e aberto.
O projeto BioGeomancer é uma colaboração mundial de especialistas em história natural e dados geoespaciais. O objetivo primário é maximizar a qualidade e quantidade de dados sobre biodiversidade que podem ser mapeados para subsidiar ações de pesquisa, planejamento, conservação e gestão. O projeto promove a discussão, trabalha com dados espaciais e padrões e desenvolve ferramentas para alcançar o objetivo proposto.
DataTester é um software de código aberto desenvolvido para assistir em algumas tarefas para checar possíveis erros em dados de coleções biológicas. Foi desenvolvido pelo CRIA com apoio do GBIF e da Fundação Gordon and Betty Moore.
Incofish é um projeto financiado pela Comissão Européia coordenado pelo Leibniz Institut für Meereswissenschaften, Kiel, Alemanha. O projeto envolve 35 instituições de 22 países (12 européias, 12 latino americanas, 6 asiáticas e 5 africanas). O papel do CRIA será o desenvolvimento de ferramentas de mapeamento.
DesktopGarp é um projeto desenvolvido com o Biodiversity Research Center da Universidade do Kansas, nos Estados Unidos. É um pacote de software voltado para a pesquisa em biodiversidade e ecologia que permite ao usuário fazer previsões, modelar e analisar a distribuição geográfica de espécies selvagens.
Taxonomia
A Lista de Espécies da Flora do Brasil é um projeto coordenado pelo Jardim Botânico do Rio de Janeiro em parceria com o CRIA, responsável pelo desenvolvimento do sistema de informação. Todo o processo de validação e inclusão de novos dados é feito online por uma rede de mais de 400 taxonomistas do país e do exterior. A versão de acesso público foi concluída em maio de 2010.
O projeto Flora brasiliensis tem o apoio da Fapesp, Natura e Fundação Vitae. Tem por objetivo criar um sistema de informação on-line, tendo como base as imagens digitalizadas em alta resolução das 3811 pranchas da obra Flora brasiliensis de Martius. O sistema será composto das pranchas digitalizadas e de um banco de metadados com informações sobre o conteúdo das imagens (nome científico da planta, volume, número, página, etc). O sistema básico será ainda integrado a sistemas já existentes no CRIA (SinBiota, rede speciesLink).
O sistema Flora brasiliensis revisitada, está utilizando ferramentas hoje disponíveis para a construção colaborativa de sistemas através da Internet. O objetivo é desenvolver um checklist de plantas superiores com os nomes dos táxons atualmente aceitos, complementado com outras informações taxonômicas e imagens. O sistema está integrado com o sistema Flora brasiliensis on-line e dessa forma tem também a função de atualizar os nomes citados na obra.
A Finep está apoiando a elaboração do catálogo taxonômico para as espécies de abelhas presentes na região Neotropical. O projeto está sendo desenvolvido pela Universidade Federal do Paraná em parceria com o CRIA.
Integrated Taxonomic Information System tem como meta criar uma base de dados de fácil acesso com informação confiável sobre nomes de espécies e sua classificação hierárquica. Trata-se de uma parceria entre agências dos Estados Unidos, Canadá e México, outras organizações (entre elas o CRIA) e especialistas em taxonomia. ITIS também é um parceiro do Species 2000 e do Global Biodiversity Information Facility (GBIF).
Bancos de Dados
O banco de dados Neofrug reúne informações sobre as interações entre animais frugívoros e plantas da região Neotropical. Trata-se de uma iniciativa do Laboratório de Interações Vertebrados-Plantas - UNICAMP com financiamento da FAPESP.
O Banco de Dados de Fenologia reúne informações sobre as fenofases de espécies da Estação Experimental de Silvicultura Tropical e da Reserva Ducke. Trata-se de uma parceria entre o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq, a Universidade Estadual Paulista - UNESP, o Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA e o Centro de Referência em Informação Ambiental - CRIA
Estratégia
O projeto Diretrizes e Estratégias para a Modernização de Coleções Biológicas Brasileiras e a Consolidação de Sistemas Integrados de Informação sobre Biodiversidade produziu uma série de documentos de apoio para o estabelecimento de uma estratégia para o país. O projeto tem o apoio do Ministério da Ciência e Tecnologia e do Centro de Gestão e Estudos Estratégicos.
Para o projeto Amazon Basin Biodiversity Information Facility - ABBIF, o Global Biodiversity Information Facility (GBIF) e CRIA (Centro de Referência em Informação Ambiental) estão realizando um estudo de viabilidade para identificar potenciais provedores de dados ou mantenedores de sistemas de informação, estudar diferentes arquiteturas e avaliar a infra-estrutura existente e necessária para propor um sistema de informação distribuído e coordenado para a região Amazônica associada a um ambiente de modelagem, propiciando uma participação ampla e inclusiva de organizações locais. O objetivo é aumentar o valor, visibilidade e uso de dados sobre a bacia amazônica através de uma rede dinâmica, dessa forma contribuindo para melhores práticas de conservação e uso sustentável dos recursos naturais da região. A meta é aumentar o valor, visibilidade e uso dos dados da bacia Amazônica através de uma interação dinâmica e dessa forma contribuir para melhores práticas de conservação e uso sustentável dos recursos naturais da região. Esse estudo conta com o financiamento da Fundação Gordon e Betty Moore.
Projetos Concluídos
Hydro foi um projeto em parceria com a CETESB e CENA/USP cujo objetivo foi disponibilizar uma base de dados georeferenciada sobre a qualidade da água dos recursos hídricos da bacia do rio Piracicaba. Foi estruturado um sistema piloto de informação capaz de subsidiar os trabalhos de gestão de recursos hídricos na bacia, com o objetivo de contribuir para um melhor entendimento sobre o funcionamento dos ecossistemas da bacia, bem como para a construção de um novo paradigma sobre gerenciamento dos recursos hídricos. A fase piloto foi concluída, o conceito técnico foi comprovado, mas não houve interesse por parte das agências financiadoras de criar mecanismos de atualização permanente do protótipo.
O Projeto I3N teve por objetivo desenvolver um sistema piloto de uma rede de informação distribuída e interoperável sobre espécies invasoras nas Américas. O IABIN invasives Information Network (I3N) está sendo mantido pelo nó dos Estados Unidos da rede IABIN.